益生菌不同其他的保健食品是在補充體內的某種營養素，益生菌本身是活性微生物的統稱，因此有分門別類，也就是國中生物科本裡的界門綱目科屬種，再細分會有菌株。
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而一般的益生菌產品成分上面標記的會是屬跟種，比較正規的會再標記到菌株。
舉一個最知名、最常聽到的菌 – LGG菌
Lactobacillus rhamnosus GG
前面的Lactobacillus就是屬，表示乳桿菌屬，也是在俗稱「乳酸菌」裡的最大宗
後面的rhamnosus就是種，表示鼠李糖種
最後的GG就是菌株名稱
最前面兩項的屬、種代表著此菌的特性跟習性，主要與定殖的部位、是否厭氧、適合生長溫度、代謝後會產生麼物質…等習性有關。
而菌株名稱往往代表著這隻菌株是經過某一項特殊實驗有特定的功效。
同一種菌但不同株功效差很多，比如說我們都是台灣人(同一種菌)、但不是每個人都像周杰倫(菌株)一樣會唱歌。
益生菌成分重點一：看菌株最重要
為什麼說益生菌成份看菌株最重要呢?
在選益生菌時，選菌株名稱可以看出兩件事情：(1)是否有經研究證實、(2)證實的功效是什麼
舉上面的Lactobacillus rhamnosus GG(LGG菌)的例子，即便都是鼠李糖乳桿菌，GG這隻菌有針對異位性皮膚炎、調整體質、緩解抗生素帶來的副作用…等相關證實，不代表其他鼠李糖益生菌都有一樣的功效。
再舉一個例子，大家應該多少聽過的LP33吧！LP33的全名是Lactobacillus Paracasei 33，為副乾酪乳桿菌、菌株是33，常常被簡稱LP-33（取每個字字首），研究有『治療過敏性鼻炎（AR）療效的臨床證據』；同樣為副乾酪乳桿菌的HB89株，則有針對減輕pm2.5刺激的呼吸道過敏的實驗研究。兩者所做的具備的研究實驗並不相同。
資料來源：益生菌-維基百科
兩者都是同一種菌，但不同株的功效就有差。
菌株往往對應的是某種益生菌的功效。
因此，若益生菌產品的成分中只寫菌種沒有提及菌株，甚至只寫「乳酸菌」或「乳酸菌粉」，那該產品極有可能功效不明，或是使用來路不明的菌，但基本上應該還是多少會有維護腸道機能的作用。
辨別益生菌菌株的亂象
現在我們都是到菌株代表的是一款益生菌有沒有功效的依據，沒有寫的很有可能就是來路不明的菌株，但不是每一間廠商都有能力花錢做實驗、都有能力拿到實驗證實的菌株原料，這造就部分廠商會為了「讓來路不明的菌看起來有研究」，而將不知名的菌株自行命名。
怎麼辨別這些魚目混珠的廠商?
其實很簡單，把整個菌的名稱貼到PUDMED上面，便知有沒有。
【如果以上面的例子來說就是連菌種與菌株名稱(Lactobacillus rhamnosus GG)一起複製到PUDMED上面查詢】
如果什麼資訊都查不到，那恭喜你，抓到一間不怎麼老實的廠商。
益生菌成分重點二：看菌數
一般人能快速辨認產品菌數的方法：
- 若是針對腸胃保健的益生菌，菌數需加入至少20~100億的菌數
- 若是針對抗過敏的益生菌，菌數需加入至少100的菌數才能達到功效
這樣的方式確實是比較快速能夠分辨，一款益生菌產品的菌數是否足夠，但實際上，其實更複雜一點…
實際上菌數要達到實驗證實有效的劑量
若益生菌是有經過實驗證實的，產品要「吃了有效」，菌數是要達到實驗證實中的劑量才能有某種功效的顯現(就如最剛開始定義益生菌為「當攝取足夠量時可為宿主帶來健康益處的活微生物」)。
舉例來說：LGG菌有研究證實可以治療兒童急性腹瀉
(參考資料：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31543689/)
在這個研究中，每天攝取>10億的劑量有效減少輪狀病毒引起的腹瀉持續時間。
也就是說如果你是要吃兒童急性腹瀉的，產品中的LGG菌就至少要有10億的菌才會有效。
辨別益生菌菌數的亂象
剛說光是菌株名稱就有亂象，菌數當然也有。
只標總菌數100億，但整個產品裡面放了複合菌株12種
這其實是一種行銷的話術，只寫總菌數其實很難知道真正有功效的那隻加了多少，有沒有加足夠。
一款產品裡面複合菌株12種，其中一隻是LGG菌，但因為成本考量只放了5億的菌數，其他的就用來路不明的菌、成本較低的充數菌來讓他補到總共100億的菌數。
這樣既有LGG菌當作招牌、也補足了菌數>100億這個標準，但實質上恐怕吃進去的只有安慰劑的作用，因為主要功效菌株未達實驗菌數、無法達到任何功效。
用菌數要怎麼挑益生菌?
有2個比較直接方法
- 選擇成分中的每一個菌株都有寫數量的產品
菌株配方放了5種菌，5種菌各放了多少菌數是最理想的狀態。
目前這樣做的產品在國內可以說十隻手指頭數得出來，但確實是有廠商這樣做。 - 買益生菌配方裡面只有放單一隻菌的產品
觀察一遍市售的益生菌，反而產品裡面只放一隻菌的會比較乖的寫上菌數，雖然比複合菌株的產品菌數少很多，但至少人家是實實在在的菌數，不會存在充數、劣質菌的問題。
益生菌成分重點三：是否含益生質
有沒有益生質就比較一翻兩瞪眼，有就有、沒有就沒有，相較於上面兩個重點，這一點影響倒比較小。
益生元主要是作為益生活菌的營養來源、幫助好菌生長、繁殖，並增加活菌存活率，大部分為水溶性膳食纖維，常見的有寡糖類與玉米來源可溶性纖維。
※ 若產品中未加入益生元，從日常的水果、蔬菜中就可以攝取的到。
延伸閱讀：益生元、後生元是益生菌嗎?
益生菌菌種中英對照表
| 菌種英文 | 菌種中文 | 別名 |
|---|---|---|
| Lactobacillus 乳酸桿菌屬 | ||
| Lactobacillus acidophilus | 嗜酸乳桿菌 | A菌、亞斯菲德菌 |
| Lactobacillus casei variety rhamnosus | 酪乳酸桿菌 | |
| Lactobacillus casei | 乾酪乳桿菌 | C菌、凱氏乳桿菌 |
| Lactobacillus delbrueckii | 德氏乳桿菌 | |
| Lactobacillus fermentum | 酵素乳桿菌 | F菌、發酵乳桿菌 |
| Lactobacillus gasseri | 加氏乳桿菌 | 格氏乳桿菌 |
| Lactobacillus helveticus | 瑞士乳酸桿菌 | |
| Lactobacillus kefiri | 克菲爾乳酸菌 | |
| Lactococcus lactis | 乳酸乳球菌 | |
| Lactobacillus paracasei | 副乾酪乳桿菌 | |
| Lactobacillus plantarum | 植物乳桿菌 | 胚芽乳桿菌 |
| Lactobacillus pentosus | 戊糖乳桿菌 | |
| Lactobacillus rhamnosus | 鼠李糖乳桿菌 | R菌 |
| Lactobacillus reuteri | 羅伊氏乳桿菌 | |
| Lactobacillus salivarius | 唾液乳桿菌 | |
| Lactobacillus sporogenes | 凝結芽孢桿菌 | 芽孢乳酸菌 |
| Lactobacillus johnsonii | 約氏乳桿菌 | |
| Bifidobacterium 雙歧桿菌屬 (B菌) | ||
| Bifidobacterium bifidum | 雙叉雙歧桿菌 | 比菲德氏菌、比菲德氏B菌 |
| Bifidobacterium breve | 短雙歧桿菌 | |
| Bifidobacterium infantis | 嬰兒雙歧桿菌 | |
| Bifidobacterium longum | 長雙歧桿菌 | 龍根菌 |
| Bifidobacterium animals subsp.lactis | 乳雙歧桿菌 | 雷氏特B菌 |
| Bacillus Mesentericus | 糖化菌 | |
| Bacillus subtilis | 枯草桿菌 | |
| Bacillus natto | 納豆菌 | |
| Bacillus coagulans | 凝結芽孢桿菌 | 芽孢乳酸菌 |
| Clostridium 梭菌屬 | ||
| Clostridium butyricum | 丁酸梭菌 | 酪酸菌 |
| Pediococcus片球菌屬 | ||
| Pediococcus acidilactici | 乳酸片球菌 | |
| Streptococcus 球菌屬 | ||
| Streptococcus thermophilus | 嗜熱鏈球菌 | |
| Streptococcus faecalis | 糞腸球菌 | |